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选择StepOnePlus™实时荧光定量PCR系统时,需要了解以下几个关键参数,以确保它能够满足您的实验需求。这些参数可以分为两大类:系统硬件性能参数和实验应用相关参数。
一、赛默飞StepOnePLus实时荧光定量PCR系统性能参数
1、检测通道和滤光片
(1)关键点:StepOnePlus是四色通道系统。这意味着它可以同时检测最多四种不同的荧光信号。
(2)检测方法:如果您使用TaqMan探针(如FAM, VIC)或SYBR Green染料法,需要确认染料/探针的荧光基团是否与仪器的滤光片波长匹配。StepOnePlus的标配通道通常能覆盖FAM, SYBR Green, VIC/JOE, NED/TAMRA/Cy3, ROX™等常用荧光基团。
(3)多重检测能力:如果您需要在一个反应孔里同时检测多个靶基因(多重PCR),四通道的限制就很重要。例如,一个通道用于内参基因,那么最多还能检测三个目标基因。
2、通量
(1)关键点:StepOnePlus采用96孔板标准格式。
(2)样本数量:您一次实验最多需要运行多少个样本?包括标准品、待测样本、阴性对照等。96孔板除去对照,通常一次运行可处理80-90个样本。
(3)实验规划:如果您的样本量经常接近或超过96个,可能需要考虑更高通量的仪器(如Applied Biosystems 384孔或更高通量的系统),或者接受分批次运行,这会增加时间和试剂成本。
3、动态范围
(1)关键点:指仪器能够准确定量从低浓度到高浓度模板的范围,通常用数量级表示(例如,10个数量级)。
(2)需要了解:StepOnePlus具有很宽的动态范围(通常可达10个数量级),这对于准确量化拷贝数差异巨大的样本(如病毒载量检测、基因表达高低悬殊的样本)至关重要。
4、灵敏度
(1)关键点:指仪器能够检测到的低模板拷贝数。
(2)需要了解:如果您的研究涉及痕量核酸的检测(如微量病原体、低丰度基因表达、循环肿瘤DNA等),高灵敏度是首要考虑因素。StepOnePlus的灵敏度很高,通常可以检测到单拷贝的模板。
二、赛默飞StepOnePlus实时荧光定量PCR实验应用相关参数
1、温控系统和升温速率
(1)关键点:StepOnePlus使用半导体帕尔贴技术进行温控。
(2)温控精度和均一性:这直接影响PCR扩增的效率性和特异性,确保所有反应孔的条件一致,结果可靠。
(3)升温速率:更快的升温速率可以缩短实验周期。StepOnePlus的速率属于标准水平,适合绝大多数常规qPCR实验。如果您对实验速度有高要求,可以考虑更快速的机型。
2、软件功能和分析能力
(1)关键点:配套的StepOne™ Software是操作仪器和分析数据的核心。
(2)用户界面:是否易于上手,进行程序设置、板面定义和运行监控。
(3)数据导出:能否方便地将原始数据(Ct值等)导出到其他专业分析软件(如Excel, GraphPad Prism)进行进一步处理。
3、兼容性
(1)关键点:仪器对耗材和试剂的兼容性。
(2)耗材:是否必须使用原厂的昂贵PCR板/盖膜,还是兼容其他品牌的低成本耗材(需确认光学兼容性)。
(3)试剂:系统是开放式的,可以使用任何品牌的qPCR试剂(TaqMan或SYBR Green),这给了您更大的选择和成本控制空间。
三、总结选择建议
StepOnePlus是一款非常成熟、稳定且用户友好的中端qPCR仪。它非常适合以下用户:
1、进行基因表达分析、病原体检测、SNP分型等常规qPCR实验的学术实验室或临床检测实验室。
2、样本通量在96孔板范围内。
3、注重实验结果的准确性和重复性。
4、希望平衡仪器性能与长期使用成本。
在选择前,能结合您的具体实验需求,与供应商的技术支持详细沟通,甚至可以要求进行样本测试,以最直观地验证StepOnePlus是否满足您的要求。