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NanoDrop Ultra FL在处理低浓度样品时出现偏差,核心原因是紫外吸收法的物理限制导致的信噪比不足。当DNA浓度低于2ng/μL时,测得的信号已经非常弱,和仪器本身的背景噪音几乎相当,任何微小的干扰都会被放大,导致结果不可靠。
一、具体数值可以参考下表:
1、dsDNA
测量模式:吸光度模式
检测限 (LOD):1 ng/μL
推荐用于精确定量(定量限):> 5 ng/μL
建议行动:如果浓度 >5 ng/μL,可使用。若在1-5 ng/μL之间,结果仅供参考,变异度较大。
2、RNA
测量模式:吸光度模式
检测限 (LOD):约2 ng/μL
推荐用于精确定量(定量限):> 10 ng/μL
建议行动:同上,建议浓度在检测上限范围内测量
3、dsDNA
测量模式:荧光模式
检测限 (LOD):0.1 ng/μL
推荐用于精确定量(定量限):0.1 - 100 ng/μL
建议与行动:低浓度样品的选择。覆盖了吸光模式力所不及的范围,推荐使用此模式。
4、RNA
测量模式:荧光模式
检测限 (LOD):0.2 ng/μL
推荐用于精确定量(定量限):<10 ng/μL
建议与行动:对超低浓度RNA样品进行高灵敏度检测
二、除了原理的限制,操作不当也是造成结果不准的重要原因:
1、样品问题:测量前充分混匀,特别是粘稠的基因组DNA,轻微的涡旋震荡并短暂离心(如12,000rpm,2分钟)即可。检查样品有无杂质或气泡,如有,可离心或过滤处理。
2、操作细节:确保点样量为1.5-2μL,能够形成完整的液柱。测量时,请确保样品覆盖下基座检测点,并立即放下检测臂,防止样品蒸发。
3、溶剂匹配:空白对照必须和样品溶解液一致。例如,样品用TE Buffer溶解,空白也需用相同的TE Buffer。
4、仪器状态:保持上下基座光洁,并定期使用PV-1试剂盒执行性能验证。同时,确保仪器环境稳定,无强光、无振动。
三、总结与核心建议
1、对于要求精准定量的低浓度样品(如<2 ng/μL),最佳实践是使用NanoDrop Ultra FL的荧光模式,其0.1 ng/μL的灵敏度远超吸光度模式。
2、降低背景噪音:使用与样品一致的空白缓冲液进行校正,减少背景干扰。
3、从源头提升信噪比:如果样品本身是从低丰度样本中提取的,建议优化提取或纯化流程,从源头上提升样品浓度。