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伯乐(Bio-Rad)CFX Opus Deepwell实时荧光定量PCR仪的操作方法。这是一套标准、通用的操作流程,适用于大多数实验。请务必始终参考您实验室的具体SOP(标准操作程序)和试剂盒说明书,因为不同实验的细节可能有所不同。
一、CFX Opus DeepWell实时荧光定量PCR仪操作步骤详解
整个操作流程可以概括为以下四个主要阶段,CFX Maestro软件也基本按照这个逻辑引导用户:
1、创建实验方案
(1)在CFX Maestro主界面,点击 “新建实验" 或 “创建新实验"。
(2)设定实验类型: 选择“定量PCR"。
(3)编辑实验方案:
反应体积: 输入您的反应体系总体积(例如 20 µL)。
孵育温度:
预变性: 通常为95°C,持续30秒到3分钟(根据预混液说明书推荐)。
PCR循环(扩增):
变性: 通常是95°C,持续10-15秒。
退火/延伸: 通常是60°C,持续30-60秒。在此步骤收集荧光信号。循环次数通常设为40-45个循环。
熔解曲线(可选): 如果您的实验需要(例如使用SYBR Green染料),勾选此选项。仪器会在PCR结束后自动运行熔解曲线程序,通常从65°C缓慢升温到95°C,并持续监测荧光变化。
(4)选择荧光染料/探针:
点击“检测"或“通道"设置。
根据您使用的荧光物质,选择相应的检测通道(例如,FAM, HEX/VIC, ROX, Cy5等)。ROX通常被用作参考染料,用于校正孔间误差。
为每个通道指定其检测的目标基因。
(5)保存此方案,可以为其命名以便后续调用。
2、第二步:设置板布局
(1)软件会显示一个虚拟的96孔板界面。
(2)分配样品和目标:
用鼠标选中孔或一个区域,然后在右侧面板进行设置。
样品类型: 为每个孔选择“未知"、“标准品"、“阳性对照"或“阴性对照"。
目标: 从下拉菜单中选择该孔检测的基因名称(对应之前设置的荧光通道)。
样品名称: 输入有意义的名称以便识别(例如,“Patient_1", “Std_1e6")。
对于标准品,您需要输入准确的初始模板浓度(例如,1,000,000 copies/µL),软件将根据这些点自动生成标准曲线。
(3)完成所有孔的设置后,板布局会以颜色和文字清晰显示。
3、第三步:运行前准备与上样
(1)准备反应体系:
在超净工作台或冰上,按照您的实验方案配制qPCR反应混合液。通常是将预混液、引物/探针、水和模板DNA/cDNA混合。
重要: 避免产生气泡,气泡会干扰光路和荧光信号。
将配制好的反应液分装到qPCR反应板的各个孔中。
(2)封板:
使用光学封板膜覆盖板面。确保封板膜平整、紧密地贴在板子上,没有褶皱和气泡。这是防止蒸发和污染的关键步骤。
(3)上样:
轻轻将反应板放入CFX Opus仪器的样品槽中。
注意方向: 确保板的A1孔位于仪器的左前方(通常有角标或图示指示)。
关闭仪器门,听到锁扣声确保关紧。
4、第四步:启动运行
回到CFX Maestro软件界面,检查所有设置无误。
点击 “开始运行" 按钮。
软件会弹出一个最终确认对话框,显示预计运行时间。确认后,点击“开始"。
仪器将开始运行您设定的温控程序,并实时采集荧光数据。您可以在软件界面上实时查看扩增曲线和荧光信号的变化。
二、CFX Opus DeepWell实时荧光定量PCR仪运行后数据分析
1、查看结果:
(1)扩增曲线图: 查看所有孔的扩增曲线是否正常(S型曲线),阴性对照有无扩增。
(2)标准曲线: 如果设置了标准品,软件会自动给出标准曲线,并显示其斜率、效率和R²值。理想的斜率在-3.3左右,效率接近100%,R² > 0.99。
(3)Ct值: 软件会为每个孔计算Ct值(阈值循环数)。
(4)熔解曲线(如果运行了): 查看熔解峰是否单一,以确认SYBR Green实验的特异性。
2、数据导出:
您可以将Ct值、浓度结果、扩增曲线图等导出为Excel或PDF格式,用于进一步处理和报告撰写。
三、重要注意事项
1、安全重要性: 在清洁或发生泄漏时,请务必关闭仪器电源并拔掉插头。
2、防污染: 始终使用带滤芯的吸头,并在专门区域配制反应体系,以防止气溶胶污染。
3、规范操作: 操作光学封板膜和反应板时,请佩戴手套,避免用手直接接触表面,以免影响光学读数。
4、仪器维护: 定期根据手册对仪器进行清洁和维护。如果样品发生泄漏,必须立即清洁样品槽。
5、寻求帮助: 如果遇到任何仪器报警或异常结果,请首先参考用户手册,或联系伯乐的技术支持。