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伯乐CFX DUET实时荧光定量PCR仪的操作使用方法。这是一款非常经典和用户友好的qPCR仪器,其操作流程主要分为实验准备、软件设置、运行仪器和数据分析四个部分。
一、伯乐CFX DUET实时荧光定量pCR仪软件设置 - 创建并运行一个实验
在CFX Maestro软件主界面,点击 “新建实验"。
1、步骤1:设置实验类型和检测染料
(1)实验类型:选择 “定量PCR"。
(2)检测模式:
探针法:如果您使用了TaqMan探针等,选择 FAM 或其他对应荧光基团。
染料法:如果您使用了SYBR Green I等染料,选择 SYBR。
您也可以在一个实验中同时设置多种检测模式(例如,一部分孔用FAM,另一部分用HEX/VIC/JOE),这就是“DUET"名称的由来,支持双色检测。
2、步骤2:设置板布局
软件界面会显示一个虚拟的96孔板图。
(1)指定样品类型:
未知样品:您的待测样本。
阳性对照:已知含有目标序列的样品。
阴性对照:不含模板的样品(如用水代替),用于检测是否有污染。
标准品:用于制作标准曲线。您需要输入每个标准品的已知浓度。
(2)指定目标基因:为每个孔或每组孔指定检测的基因名称(例如,GeneA, ActB)。
(3)指定荧光染料:为每个孔或每组孔指定所使用的荧光通道(如FAM, SYBR)。
3、步骤3:设置反应程序
这是qPCR反应的核心步骤,通常包括三个阶段:
(1)酶激活步骤(可选,取决于预混液):
温度:95 °C
时间:2-10 分钟
循环数:1
(2)扩增循环(PCR循环) - 重复运行40-45个循环:
变性:
温度:95 °C
时间:10-30 秒
退火/延伸:
温度:55-65 °C(根据您的引物TM值优化)
时间:30-60 秒
在此步骤末采集荧光信号。
(3)熔解曲线分析(仅适用于SYBR Green染料法):
程序会自动添加。通常是从65°C缓慢升温到95°C,在此过程中连续采集荧光信号,用于确认扩增产物的特异性。
(4)步骤4:开始运行
检查所有设置无误后,点击右上角的 “开始运行" 按钮。
系统会弹出对话框,让您输入实验名称并选择保存位置。
确认后,仪器将开始运行程序。您可以在软件界面上实时查看反应进程、荧光信号增长曲线和温度变化。
二、伯乐CFX DUET实时荧光定量PCR仪运行后数据分析
1、查看扩增曲线:
软件会自动设置基线阈值和Ct值。您可以检查扩增曲线是否平滑,S形曲线是否典型。
2、查看熔解曲线(仅SYBR Green法):
确认每个样品只有一个单一的尖峰。如果出现多个峰,可能意味着有引物二聚体或非特异性扩增。
3、结果分析:
相对定量(常用方法):使用 ΔΔCt法 计算基因的相对表达量。您需要指定内参基因和对照组。
定量:如果您使用了标准品,软件会自动生成标准曲线,并根据曲线计算出每个未知样品的绝对拷贝数或浓度。
4、导出数据:您可以将结果(包括图表和数据表格)导出为PDF或Excel文件,用于报告和进一步处理。
三、重要注意事项与日常维护
1、安全重要性:在运行前确保板子或管子已密封,防止生物污染。
2、保持清洁:定期用蘸有70%乙醇的无尘纸擦拭样品槽的表面,防止灰尘或污染物影响光学系统。
3、避免强光直射:将仪器放置在稳定、无振动、远离强光源和磁场的地方。
4、软件熟悉:花些时间熟悉CFX Maestro软件的各个功能,它非常强大且直观。
5、预混液说明书:不同厂家的qPCR预混液推荐的反应程序可能略有不同,请以您所用试剂的说明书为准进行微调。
开机 → 打开CFX Maestro → 新建实验 → 设置检测染料 → 设置板布局(指定样品、基因)→ 设置反应程序(激活、变性、退火/延伸、熔解曲线)→ 保存并开始运行 → 分析数据(扩增曲线、熔解曲线、定量)→ 导出报告