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伯乐(Bio-Rad)的 CFX Opus 96 是一款高性能、高通量的实时荧光定量PCR仪。核心功能是进行qPCR 实验,但凭借其精确的温控、灵敏的光学检测系统和灵活的软件,它可以完成多种基于PCR实验。以下是CFX Opus 96可以进行的主要实验类型,从常见到专业的:
一、伯乐CFX Opus 96实时荧光定量PCR仪基础应用
1、基因表达分析
这是广泛的应用。 通过检测样本中特定mRNA的量,来研究基因在何种条件下、在哪些组织或细胞中表达。
应用实例:研究癌症组织中某个癌基因的表达是否上调;比较药物处理前后细胞中炎症因子基因的表达变化。
2、病原体检测与鉴定
高灵敏度和特异性使其成为检测病毒、细菌、真菌等病原体的黄金标准。
应用实例:新冠病毒、流感病毒、HPV病毒分型、食品安全中的致病菌检测等。
3、转基因成分检测
定性或定量检测食品、饲料或植物样本中是否含有转基因成分。
4、SNP分型
检测单核苷酸多态性,用于基因突变分析、药物基因组学、遗传病筛查等。通常需要使用特定的探针或染料。
二、伯乐CFX Opus 96实时荧光定量PCR仪高级应用
1、数字PCR
注意:CFX Opus 96本身是一台qPCR仪。但要进行定量的数字PCR,需要额外配备伯乐的QX200 Droplet Digital PCR系统。流程是:先用QX200系统生成微滴并完成PCR扩增,然后将96孔板放到CFX Opus 96上进行终点荧光检测,最后通过软件分析每个微滴的荧光信号,实现定量。所以,它可以作为ddPCR工作流中的一个组成部分。
2、高分辨率熔解曲线分析
CFX Opus 96具有出色的熔解曲线分析功能,可以:
基因分型:区分不同的基因型,如突变型、野生型和杂合型。
突变扫描:检测PCR产物中是否存在未知的突变或单碱基差异。
甲基化分析:结合重亚硫酸盐处理,可以用于DNA甲基化水平的研究。
3、microRNA表达分析
由于miRNA分子非常短,需要特殊的茎环法引物或加尾法来进行逆转录和qPCR。CFX Opus 96的高灵敏度使其非常适合检测这种低丰度、小片段的RNA。
4、多重PCR
在一个反应管内同时检测多个目标基因。这要求仪器具有多个、且光谱不重叠的荧光通道。CFX Opus 96通常配置有3-5个荧光通道,可以轻松进行双重、三重甚至更多重的qPCR实验,大大提高效率和节省样本。
三、总结
伯乐CFX Opus 96 PCR仪的核心能力可以概括为:
1、高精度定量:不仅能判断“有或无",还能精确知道“有多少"。
2、高灵敏度:可以检测极微量的核酸样本。
3、高特异性:通过探针法和熔解曲线分析,确保检测结果的准确性。
4、高通量:96孔板格式适合中等通量的筛选和验证实验。
5、多功能性:通过不同的实验设计和试剂盒,可以实现从基础的基因表达到高级的突变分析等多种应用。
在选择实验方案时,您需要根据具体的研究目标,搭配相应的试剂盒、引物和探针,并利用CFX Maestro软件进行实验设计和数据分析。对于定量的数字PCR,请记住需要配合QX200系统使用。