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赛默飞世尔科技的QuantStudio™ 3实时荧光定量PCR系统是一款经典的96孔基础型qPCR仪,其耗材和试剂选择非常成熟和广泛。总的来说,您需要准备以下几大类:
一、赛默飞QuantStudio3实时荧光定量PCR核心耗材
1、反应板/板膜组合
QuantStudio 3是96孔标准模块,因此您需要选择96孔的板子和对应的密封膜。赛默飞提供了多种选择以适应不同的实验需求和预算:
(1)微孔板:
标准96孔板: 常用的类型,例如 MicroAmp™ Fast Optical 96-Well Reaction Plate (货号: 4346906)。
光学级96孔板: 确保良好的光学性能,减少信号交叉干扰。
(2)密封膜:
光学平盖膜: 与大多数试剂兼容,需要专用的压膜工具密封,密封性好。例如 MicroAmp™ Optical Adhesive Film (货号: 4311971)。
八联管盖: 如果您使用八联管,则需要匹配的管盖。例如 MicroAmp™ Optical 8-Cap Strip (货号: 4323032)。八联管的好处是可以在部分孔中进行实验,灵活性高。
二、赛默飞QuantStudio3实时荧光定量PCR核心试剂
qPCR试剂是反应发生的化学基础,主要分为两大类:染料法和探针法。
1、预混液
这是常用、方便的形式,已将DNA聚合酶、dNTPs、缓冲液等组分预先混合好,用户只需加入引物、模板和水即可。
(1)SYBR Green法(染料法):
PowerUp™ SYBR™ Green Master Mix (货号: A25742): 性能优异,含有ROX染料校正,适合大多数应用。
SYBR™ Green PCR Master Mix: 经典选择。
特点: 经济、通用性强,但特异性略低于探针法,需要配合熔解曲线分析来确认产物的单一性。
(2)TaqMan法(探针法):
TaqMan™ Fast Advanced Master Mix (货号: 4444557): 快速、灵敏,是进行探针法qPCR的重要选择。
特点: 特异性高,适用于多重检测(同时检测多个目标基因),但成本较高,需要针对特定基因序列设计并合成探针。
2、关键组分
如果您不使用预混液,则需要自行配制体系,包括:
热启动Taq DNA聚合酶
dNTPs
缓冲液
镁离子
荧光染料 或 探针
对于绝大多数用户,直接购买预混液是高效、可靠的选择。
三、其他辅助耗材与试剂
1、样品制备阶段:
(1)RNA/DNA提取试剂盒: 如 Invitrogen™ PureLink™ 系列。
(2)无核酸酶水: 用于稀释和配制反应体系。
(3)RNase抑制剂: 如果进行RT-qPCR,用于防止RNA降解。
2、液体操作:
(1)无滤芯吸头: 用于移取模板、引物等。
(2)带滤芯吸头: 强烈推荐用于移取预混液,可防止气溶胶污染和交叉污染。
(3)PCR管/板: 用于配制主混合物。
3、逆转录试剂(用于RT-qPCR):
如果您是从RNA开始实验,需要先将RNA逆转录成cDNA。例如 SuperScript™ IV First-Strand Synthesis System。
四、总结与工作流程示例
一个典型的SYBR Green RT-qPCR实验流程所需清单如下:
1、RNA提取: RNA提取试剂盒、无RNase的离心管和吸头。
2、逆转录: 逆转录酶、随机引物/ Oligo dT、dNTPs、RNase抑制剂、无核酸酶水。
3、qPCR反应体系配制:
(1)试剂: PowerUp? SYBR? Green Master Mix、基因特异性引物、无核酸酶水、cDNA模板。
(2)耗材: 96孔反应板、光学粘封膜、带滤芯的吸头、用于配制主混合物的离心管。
4、上机运行: 将密封好的反应板放入QuantStudio 3中,设置程序并运行。