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Thermo赛默飞7500实时荧光定量PCR系统正确操作方法

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赛默飞世尔科技 Applied Biosystems 7500 实时荧光定量PCR系统的标准、安全操作流程。赛默飞世尔科技 Applied Biosystems 7500 实时荧光定量PCR系统的标准、安全操作流程。操作必须由经过培训的人员在符合生物安全规定的实验室中进行。不同版本的软件界面可能略有差异,但核心步骤一致。


赛默飞7500实时荧光定量PCR系统标准操作流程


一、开始阶段:实验前准备

1、仪器准备

(1)开机: 依次打开电脑主机、显示器,然后打开7500仪器主机电源(通常在仪器背面)。

(2)启动软件: 双击桌面上的 “7500 System Software" 图标启动软件。软件将自动进行自检和初始化,此过程约需10-15分钟。请等待初始化完成,直至主界面就绪。

(3)检查耗材: 确认有足够的一次性 MicroAmp® Optical 96-Well或8-Strip Reaction Plates(反应板)和 Optical Adhesive Covers(光学封膜)。


2、实验设计

(1)创建实验文件: 在软件主界面,选择 “Create New Experiment" 或 “File -> New"。

(2)选择实验类型: 在实验设置向导中,选择 “Quantitation (Standard Curve)"(标准曲线定量)、“Comparative Ct (ΔΔCt)"(相对定量)或其他适合您实验的类型。

(3)设置探针/染料: 在 “Detectors" 或 “Dye Manager" 中,添加您实验中使用的荧光染料(如 FAM, VIC)或探针。为每个检测目标指定名称和报告基团/淬灭基团类型。

(4)设置反应体系: 指定反应体积(通常为20-50 μL)。

3、配制PCR反应体系

(1)在冰上或超净工作台中操作: 确保所有试剂解冻并短暂离心。

(2)配制预混液: 根据实验设计,按比例混合除模板DNA外的所有试剂(如Master Mix、引物、探针、水)。建议配制一定冗余(例如,多配10%的量)以补偿加样误差。

(3)分装: 将预混液分装到PCR反应板或八连管中。

(4)加入模板: 最后加入模板DNA,并轻轻混匀(避免产生气泡)。强烈建议设置复孔(至少3个技术重复)以及阴性对照(No Template Control, NTC)和阳性对照。

(5)封膜: 使用光学封膜密封反应板,确保封膜平整、无褶皱、无气泡。然后用压膜器或滚轮用力压实边缘。

4、上样

(1)清洁样品槽: 用无水乙醇和无尘纸轻轻擦拭7500仪器的样品槽基座,去除任何灰尘或污染物。

(2)放置反应板: 将封好膜的反应板放入样品槽中,确保反应板的左上角(A1孔)对准样品槽的左上角标记。轻轻向下按压四角,确保板子放置平稳。


二、第二阶段:上机运行

1、创建运行方法

(1)设置反应板布局: 在软件界面,点击 “Plate Setup" 选项卡。通过拖放或双击,为每个孔指定其样品名称、任务类型(未知样品、标准品、阴性对照等)和对应的检测探针(Detector)。

(2)编辑运行程序:

点击 “Instrument" 选项卡。

Stage 1 (升温阶段): 通常为 50°C for 2 minutes(UDG酶防污染孵育,如果试剂包含此成分)。

Stage 2 (预变性): 通常为 95°C for 10-20 minutes(热启动酶活化)。

Stage 3 (PCR循环): 设置40-50个循环,包括:

(3)变性: 95°C for 15 seconds。

退火/延伸: 60°C for 1 minute。在此步骤采集荧光信号。软件通常会自动设置为在60°C阶段采集信号。

(可选)溶解曲线阶段: 如果使用SYBR Green染料,需添加溶解曲线步骤。

2、开始运行

(1)保存方法: 保存您的实验文件和运行方法。

(2)启动运行: 点击工具栏上的 “Start Run" 按钮。

(3)确认运行参数: 在弹出的对话框中,再次确认反应板位置、运行方法文件名和样品文件名无误。

(4)开始运行: 点击 “OK",仪器将开始运行。运行过程中,您可以实时查看扩增曲线和荧光信号的变化。


三、第三阶段:数据分析与关机

1、数据分析

(1)运行结束后,软件会自动保存数据。

(2)设置基线阈值(Threshold)和基线(Baseline): 这是数据分析的关键步骤。

软件通常会自动设置,但手动调整可能使结果更准确。

阈值(Threshold): 设置在指数扩增期的线性范围内,通常为荧光信号刚进入指数增长阶段的水平。所有样本的阈值线应保持一致。

基线(Baseline): 设置为背景荧光信号平稳的循环数范围(通常是前3-15个循环)。

(3)查看结果: 软件会自动给出每个样品的Ct值。您可以在 “Results" 页面查看扩增曲线、标准曲线(如果做了)、熔解曲线(如果做了)以及最终的定量结果。

2、关机

(1)取出反应板: 运行结束后,打开仪器盖子,小心取出反应板。注意:反应板可能很烫,请佩戴防烫手套。

(2)处理废液: 根据您实验室的生物安全规定,将反应板作为生物有害废物妥善处理。

(3)清洁样品槽: 再次用无水乙醇和无尘纸清洁样品槽。

(4)关闭软件: 在电脑上退出7500系统软件。

(5)关闭仪器: 先关闭7500仪器主机电源,然后再关闭电脑。


遵循以上标准操作流程,并结合您具体的实验方案和试剂说明书进行优化,将能确保您获得可靠、准确的实时荧光定量PCR结果。如有任何不确定之处,请务必咨询经验丰富的同事或赛默飞的技术支持。

TEL:18016231680

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