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完成ABI 7500实时荧光定量PCR(qPCR)实验后,下一步的关键步骤包括数据分析、结果验证和实验记录整理。以下是详细的后续操作指南:
一、ABI 7500数据分析
ABI 7500软件会自动生成扩增曲线、熔解曲线(SYBR Green法)和Ct值等数据,需进行以下分析:
1、扩增曲线检查:确保所有样本的扩增曲线呈典型的S形,指数期明显,平台期稳定。异常的扩增曲线(如无扩增、非特异性扩增)需排查原因。
2、熔解曲线分析(SYBR Green法):单一尖锐峰表明特异性扩增,多峰或宽峰可能提示引物二聚体或非特异性产物。
3、Ct值提取:用于定量分析,软件可自动计算,但需手动调整阈值(通常设在指数扩增期)以提高准确性。
标准曲线评估(绝对定量):检查扩增效率(90%-110%)、R²值(≥0.98)及线性范围。
二、结果验证
1、重复实验:若个别样本数据异常(如Ct值偏差大),需重复实验。建议整板重做以确保可比性,避免仅重做部分孔导致批次误差。
2、阴性/阳性对照确认:确保阴性对照无扩增,阳性对照Ct值在预期范围内。
3、引物优化:若熔解曲线异常(如黄三角警告),可能需重新设计引物或优化退火温度。
三、数据导出与报告生成
1、导出数据:软件支持导出Ct值、荧光数据等,格式可为Excel或文本文件。
2、相对定量计算(如2−ΔΔCt法):需内参基因校正,确保样本间归一化。
3、结果可视化:绘制柱状图、热图等展示基因表达差异或病原体载量。
四、实验记录与仪器维护
1、记录实验参数:包括程序设置、试剂批次、样本信息等,便于追溯。
2、仪器维护:清洁样品槽,检查光源寿命(卤钨灯约2000小时),定期校准。
3、数据备份:建议使用光盘或加密存储,避免U盘直接拷贝(部分实验室规定)。
五、常见问题处理:
1、蒸发问题:更换高质量PCR管或增大反应体系(如30 μL)。
2、气泡干扰:上机前瞬离心去除。